UCL-3500紫外交联仪用于CLIP-seq实验
UCL-3500紫外交联仪为一款254nm短波紫外交联仪,内部安装了6根15w 254nm紫外线灯管,采用了铝合金辐照腔,辐照腔面积大,紫外线辐照均匀,满足各种紫外线辐照实验,是Northern, Southern,Slot或Dot印迹固膜、CLIP-seq实验的工具。
CLIP-seq,又称为HITS-CLIP,即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(crosslinking-immunoprecipitation and high-throughput sequencing), 是一项在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。
CLIP-seq主要原理是基于RNA分子与RNA结合蛋白在254nm紫外照射下发生耦联,以RNA结合蛋白的特异性抗体将RNA-蛋白质复合体沉淀之后,回收其中的RNA片段,经添加接头、RT-PCR等步骤,对这些分子进行高通量测序,再经生物信息学的分析和处理、总结,挖掘出其特定规律,从而深入揭示RNA结合蛋白与RNA分子的调控作用及其对生命的意义。
CLIP-seq 紫外辐照能量设置为:
打开UCL-3500紫外交联仪电源。
将要辐照的细胞放进紫外交联仪的辐照腔内。
按压程序按键(program)选择能量模式(energy),能量模式绿色指示灯点亮。
通过数字按键按压0.4,再按enter按键,0.4J/cm2能量设置完成。
按start按键,辐照开始,显示屏显示剩余能量,辐照完成后,交联仪自动停止辐照。
取出辐照的细胞,关闭交联仪电源。