电洗脱法基本原理
将电泳分离后含目的DNA片段的琼脂糖切割下来, 装于透析袋中,继续在高电压下电泳,这时目的DNA会从凝胶中电泳出进入透析袋中, 由于DNA分子量大,不能透过透析袋,从而保留于透析袋中。取出透析袋中含DNA的溶液, 进一步用酚、氯仿抽提纯化。
电洗脱法实验方法
(一)透析袋的处理:
1.切取适当长度适析袋。
2.在2%NaHCO3 1mM EDTA溶液中煮沸10分钟。
3.弃去煮沸液,加无菌水内外反复洗净透析袋。
(二)电洗脱
1.在长波紫外灯下(300-360nm )将含目标DNA片段的凝胶条带切下装入透析袋中。
2.向透析袋内加入2ml电泳缓冲液,使之浸没凝胶,并排空汽泡。
3.将透析袋水平放入电泳槽(长度方向与电泳平行), 加入适量缓冲液将透析袋浸没(约6-7mm)。
4.接通电源,150伏电洗,在紫外灯下观察待DNA全部移出凝胶。
5.改变电场方向继续通电1分钟。
6.从透析袋中吸出缓冲液于1-5ml Eppendorf管中。
7.加入1.5倍体积正丁醇,混匀抽提去EB。
8.在台式离心机上高速2分钟。
9.吸去上层,正丁醇溶液。
10.重复7,8,9二次。
11.自下层言DNA的溶液中加入等体积酚氯仿(2个)抽提2次。
12.上清转入另一Eppendorf管中加入1/10倍体积3M NaAc 2倍体积预冷无水乙醇,于20℃过夜。
13.12000g,4℃下离心10分钟,得DNA沉淀。
14.弃上清,加入70%乙醇洗涤2次后弃干乙醇。
15.加入50μl TE溶解DNA。
16.取10μl DNA溶液加入2μl Loading buffer于0.8%琼脂糖上, 40伏电泳,3小时。
17.在紫外透射仪上观察结果。
18.测定DNA溶液OD260,OD280值。
结果与分析
1.计算DNA回收效率,判断DNA纯度。
2.记录电泳结果
从琼脂糖凝胶(Agaros gel)中回收DNA片段实验步骤
1. 配制TAE电泳缓冲液(10′储存液),10′加样缓冲液,1.5ml离心管装入铝制饭盒(灭菌)、移液器吸头装入相应的吸头盒(灭菌)。
2. 操作步骤
1) 用1′TAE配制1%琼脂糖凝胶。DNA用合适的酶切。
2) 在胶上选定两个加样孔,分别加入少量(10μl)和大量(50μl )DNA酶切产物,电泳。
3) 电泳结束后用刀片切下含有少量DNA酶切产物的泳道(一般选择位于凝胶的边缘),在紫外灯下找到目的DNA 带,用刀片切在带的下上下边缘各切一个小口作为标记。注意:含有大量DNA酶切产物的凝胶既不用加荧光染料,也不用紫外灯照射!
4) 将做好标记的凝胶条与未染色的凝胶原位对齐,根据小胶条上的标记估计未染色的大胶上DNA酶切产物的位置,用刀片切下大胶中DNA产物所在的凝胶(尽量不要多余的凝胶),转移至一个称量过的干净的1.5ml微量离心管中。再称量后计算出胶的重量。
5) 按照DNA快速纯化/回收试剂盒操作说明,纯化回收目的片段。